lme4: lmer.h Source File

00001 #ifndef LME4_LMER_H
00002 #define LME4_LMER_H
00003 
00004 #include <R.h>
00005 /* Rdefines.h includes Rinternals.h (for SEXP, REAL, etc.) and defines
00006  * GET_SLOT, MAKE_CLASS, NEW_OBJECT, SET_SLOT, etc. */
00007 #include <Rdefines.h>
00008 
00009 /* SEXP lme4_rWishart(SEXP ns, SEXP dfp, SEXP scal); */
00010 
00011 SEXP mer_MCMCsamp(SEXP x, SEXP fm);
00012 SEXP mer_ST_chol(SEXP x);
00013 SEXP mer_ST_getPars(SEXP x);
00014 SEXP mer_ST_initialize(SEXP ST, SEXP Gp, SEXP Zt);
00015 SEXP mer_ST_setPars(SEXP x, SEXP pars);
00016 SEXP mer_create_L(SEXP CmP);
00017 SEXP mer_optimize(SEXP x, SEXP verb);
00018 SEXP mer_postVar(SEXP x);
00019 SEXP mer_update_L(SEXP x);
00020 SEXP mer_update_RX(SEXP x);
00021 SEXP mer_update_dev(SEXP x);
00022 SEXP mer_update_projection(SEXP x);
00023 SEXP mer_update_ranef(SEXP x);
00024 SEXP mer_update_mu(SEXP x);
00025 SEXP mer_update_u(SEXP x, SEXP verbP);
00026 SEXP mer_validate(SEXP x);
00027 SEXP merMCMC_validate(SEXP x);
00028 SEXP merMCMC_VarCorr(SEXP x, SEXP typ);
00029 
00030 SEXP spR_optimize(SEXP x, SEXP verbP);
00031 SEXP spR_update_mu(SEXP x);
00032 
00033 #endif /* LME4_LMER_H */