Here is a list of all functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the files they belong to:

- _ -

• _ : lmer.c

- a -

• A_SLOT : lmer.c
• Alloca : lmer.c
• apply_perm() : lmer.c
• AZERO : lmer.c

- b -

• BUF_SIZE : lmer.c

- c -

• c : lmer.c, init.c
• CallEntries : init.c
• chkDims() : lmer.c
• chkLen() : lmer.c
• CM_MAXITER : lmer.c
• Cm_SLOT : lmer.c
• CM_SMIN : lmer.c
• CM_TOL : lmer.c
• cvg_POS : lmer.c
• Cx_SLOT : lmer.c

- d -

• DEV_SLOT : lmer.c
• devP : lmer.c
• dimP : lmer.c
• DIMS_SLOT : lmer.c
• disc_POS : lmer.c

- e -

• ETA_SLOT : lmer.c

- f -

• FIXEF_SLOT : lmer.c
• fTyp_POS : lmer.c

- g -

• Gp_grp() : lmer.c
• Gp_SLOT : lmer.c

- i -

• INVEPS : lmer.c
• isREML_POS : lmer.c

- l -

• L_SLOT : lmer.c
• ldL2_POS : lmer.c
• ldRX2_POS : lmer.c
• lme4_ASym : Syms.h
• lme4_CmSym : Syms.h
• lme4_CxSym : Syms.h
• lme4_devianceSym : Syms.h
• lme4_devResid() : lmer.c
• lme4_dimsSym : Syms.h
• lme4_DimSym : Syms.h
• lme4_envSym : Syms.h
• lme4_etaSym : Syms.h
• lme4_fixefSym : Syms.h
• lme4_flistSym : Syms.h
• lme4_GpSym : Syms.h
• lme4_gradientSym : Syms.h
• lme4_iSym : Syms.h
• lme4_LSym : Syms.h
• lme4_muEta() : lmer.c
• lme4_muEtaSym : Syms.h
• lme4_muSym : Syms.h
• lme4_ncSym : Syms.h
• lme4_nlmodelSym : Syms.h
• lme4_offsetSym : Syms.h
• lme4_permSym : Syms.h
• lme4_pSym : Syms.h
• lme4_pWtSym : Syms.h
• lme4_ranefSym : Syms.h
• lme4_residSym : Syms.h
• lme4_RXSym : Syms.h
• lme4_RZXSym : Syms.h
• lme4_sigmaSym : Syms.h
• lme4_sqrtrWtSym : Syms.h
• lme4_sqrtXWtSym : Syms.h
• lme4_STSym : Syms.h
• lme4_uSym : Syms.h
• lme4_varFunc() : lmer.c
• lme4_varSym : Syms.h
• lme4_VSym : Syms.h
• lme4_XSym : Syms.h
• lme4_xSym : Syms.h
• lme4_ySym : Syms.h
• lme4_ZtSym : Syms.h
• lmm_update_fixef_u() : lmer.c
• lmm_update_projection() : lmer.c
• LTHRESH : lmer.c
• lTyp_POS : lmer.c

- m -

• MCMC_beta_u() : lmer.c
• MCMC_S() : lmer.c
• MCMC_T() : lmer.c
• mer_create_L() : lmer.h, lmer.c
• mer_MCMCsamp() : lmer.h, lmer.c
• mer_optimize() : lmer.h, lmer.c
• mer_postVar() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_chol() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_getPars() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_initialize() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_setPars() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_dev() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_L() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_mu() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_projection() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_ranef() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_RX() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_u() : lmer.h, lmer.c
• mer_validate() : lmer.h, lmer.c
• merMCMC_validate() : lmer.h, lmer.c
• merMCMC_VarCorr() : lmer.h, lmer.c
• ML_POS : lmer.c
• MLTHRESH : lmer.c
• MPTHRESH : lmer.c
• MU_SLOT : lmer.c
• MUETA_SLOT : lmer.c

- n -

• n_POS : lmer.c
• nAGQ_POS : lmer.c
• nest_POS : lmer.c
• nf_POS : lmer.c
• np_POS : lmer.c

- o -

• OFFSET_SLOT : lmer.c

- p -

• p_POS : lmer.c
• P_sdmult() : lmer.c
• PERM_VEC : lmer.c
• PTHRESH : lmer.c
• pwrss_POS : lmer.c
• PWT_SLOT : lmer.c

- q -

• q_POS : lmer.c

- r -

• R_init_lme4() : init.c
• R_unload_lme4() : init.c
• RANEF_SLOT : lmer.c
• RDF : lmer.c
• REML_POS : lmer.c
• RESID_SLOT : lmer.c
• RX_SLOT : lmer.c
• RZX_SLOT : lmer.c

- s -

• s_POS : lmer.c
• sigmaML_POS : lmer.c
• sigmaREML_POS : lmer.c
• SLOT_REAL_NULL() : lmer.c
• spR_optimize() : lmer.h, lmer.c
• spR_update_mu() : lmer.h, lmer.c
• sqr_length() : lmer.c
• SRWT_SLOT : lmer.c
• ST_getPars() : lmer.c
• ST_nc_nlev() : lmer.c
• ST_setPars() : lmer.c
• SXWT_SLOT : lmer.c

- t -

• theta_S_ind() : lmer.c
• Tt_Zt() : lmer.c

- u -

• U_SLOT : lmer.c
• update_A() : lmer.c
• update_L() : lmer.c
• update_mu() : lmer.c
• update_ranef() : lmer.c
• update_RX() : lmer.c
• update_u() : lmer.c
• useSc_POS : lmer.c
• usqr_POS : lmer.c

- v -

• V_SLOT : lmer.c
• VAR_SLOT : lmer.c
• vTyp_POS : lmer.c

- w -

• wrss_POS : lmer.c

- x -

• X_SLOT : lmer.c

- y -

• y_log_y() : lmer.c
• Y_SLOT : lmer.c

- z -

• Zt_SLOT : lmer.c

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