- a -

• apply_perm() : lmer.c

- c -

• chkDims() : lmer.c
• chkLen() : lmer.c

- g -

• Gp_grp() : lmer.c

- l -

• lme4_devResid() : lmer.c
• lme4_muEta() : lmer.c
• lme4_varFunc() : lmer.c
• lmm_update_fixef_u() : lmer.c
• lmm_update_projection() : lmer.c

- m -

• MCMC_beta_u() : lmer.c
• MCMC_S() : lmer.c
• MCMC_T() : lmer.c
• mer_create_L() : lmer.h, lmer.c
• mer_MCMCsamp() : lmer.h, lmer.c
• mer_optimize() : lmer.h, lmer.c
• mer_postVar() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_chol() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_getPars() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_initialize() : lmer.h, lmer.c
• mer_ST_setPars() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_dev() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_L() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_mu() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_projection() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_ranef() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_RX() : lmer.h, lmer.c
• mer_update_u() : lmer.h, lmer.c
• mer_validate() : lmer.h, lmer.c
• merMCMC_validate() : lmer.h, lmer.c
• merMCMC_VarCorr() : lmer.h, lmer.c

- p -

• P_sdmult() : lmer.c

- r -

• R_init_lme4() : init.c
• R_unload_lme4() : init.c

- s -

• SLOT_REAL_NULL() : lmer.c
• spR_optimize() : lmer.h, lmer.c
• spR_update_mu() : lmer.h, lmer.c
• sqr_length() : lmer.c
• ST_getPars() : lmer.c
• ST_nc_nlev() : lmer.c
• ST_setPars() : lmer.c

- t -

• theta_S_ind() : lmer.c
• Tt_Zt() : lmer.c

- u -

• update_A() : lmer.c
• update_L() : lmer.c
• update_mu() : lmer.c
• update_ranef() : lmer.c
• update_RX() : lmer.c
• update_u() : lmer.c

- y -

• y_log_y() : lmer.c

---